Geleitet wird das Institut von der Präsidentin. Sie wird vom Vorstand unterstützt. Die wissenschaftliche Ausrichtung entwickelt der Forschungsrat. Die Zuständigkeiten sind in der Satzung des GIGA umfassend definiert.
Präsidentin
Prof. Dr. Amrita Narlikar ist Präsidentin des GIGA und Professorin für Internationale Beziehungen an der Universität Hamburg. Außerdem ist sie Non-resident Senior Fellow bei der Observer Research Foundation (ORF).
Vorstand
Der Vorstand besteht aus der Präsidentin, dem Vizepräsidenten, den DirektorInnen der Regionalinstitute und dem Kaufmännischen Geschäftsführer.
Das Gremium steuert das Gesamtinstitut strategisch, koordiniert die Arbeit am GIGA und berät über die Verteilung der finanziellen Mittel. Der Vorstand ist zudem für alle Fragen der Personalentwicklung zuständig.
Forschungsrat
Der Forschungsrat berät über die wissenschaftliche Ausrichtung des Instituts, diskutiert die Themenentwicklung und erarbeitet den Forschungsplan. Er unterstützt den Vorstand bei Forschungs- und Personalstrategien.
Der Forschungsrat besteht aus der Präsidentin, dem Vizepräsidenten, den Direktoren der Regionalinstitute, den Forschungsschwerpunktleiter*innen, der Wissenschaftsmanagerin und der Akademischen Direktorin des Doktorandenprogramms.